15 VI 1958 podczas centralnych obchodów jubileuszu 40-lecia na dziedzińcu arkadowym na Wawelu z rąk Józefa Grzesiaka „Czarnego” Czarna Trzynastka otrzymała sztandar. „Czarny” wręczył sztandar phm. Stanisławowi Turczy – Komendantowi Szczepu. Następnie sztandar przyjął poczet sztandarowy w składzie dh. Z.Burdyl, L. Komorek J. Michalski. Później odbyła się uroczysta defilada ze wzgórza wawelskiego przez Rynek na plac Matejki. Sztandar został wcześniej poświęcony w kościele św. Szczepana; powstał dzięki staraniom Fundacji Czarnej Trzynastki. Został wykonany przez Ss. Karmelitanki z klasztoru na ul. Kopernika. Sztandar ma wymiary 100 cm x 97 cm, obrębiony jest złotymi frędzlami, w dolnym narożniku wszyty jest złoty kutasik zawieszony na złotej, plecionej nitce. Mocowany jest do drzewca karabińczykami, drzewce z 260 pamiątkowymi gwoździami sztandarowymi zwieńczone są stalową trzynastacką lilijką. Pod lilijką przypinana jest szarfa złożona z taśmy szafirowej i amarantowej.Sztandar ma zamieniony awers z rewersem. Godło państwowe (srebrny orzeł; z koroną od 1995) otoczone dwoma połowami złotego wieńca znajduje się na awersie na OJCZYZNA -NAUKA -CNOTA.
Na rewersie jest centralnie umieszczony kontur krzyża maltańskiego w barwach: czarnej (ramiona) i szafirowej (wycięcia) ze srebrnym krzyżem harcerskim ze złotą lilią, kręgiem, wieńcem, promieniami i napisem:1918 Z.H.P. 1958 – CZARNA TRZYNASTKA – IM. ZAWISZY CZARNEGO -W KRAKOWIE.